天然产物数据库

发布日期：2022-11-29 18:20 来源：研究小组作者：AgroIPM 浏览次数：

1. Dictionary of Natural Products

https://dnp.chemnetbase.com/faces/chemical/ChemicalSearch.xhtml

2. Natural Products Atlas (NP Atlas)

https://www.npatlas.org/
数据库旨在涵盖所有发表的主要科学文献中的微生物来源的天然产物。这包括细菌、真菌和蓝藻化合物，但不包括来自植物、无脊椎动物或其他高等生物的化合物，除非这些化合物也已从微生物来源明确识别。其中包括来自地衣、蘑菇和其他高等真菌的化合物，但海洋大型藻类和硅藻的化合物不包括在内。

3. Coconut

Natural Products Online is an open source project for Natural Products (NPs) storage, search and analysis. The present version hosts COCONUT, the COlleCtion of Open Natural ProdUcTs, one of the biggest and best annotated resources for NPs available free of charge and without any restriction.
https://coconut.naturalproducts.net/

4. MarinLit

https://marinlit.rsc.org/
MarinLit是一个致力于海洋天然产品研究的数据库。它包含一系列全面的数据，以及强大的去重功能。
涵盖期刊文章对海洋天然产品的全面报道，包括新的和修订的化合物、合成、生态和生物活动。《MarinLit》自2014年起由英国皇家化学学会出版。

5. StreptomeDB

链霉菌数据库，涉及Compounds，Organisms，Biosynthesis Routes，Activities，Scaffold Browser，NMR/MS Data，Phylogenetic tree
http://132.230.56.4/streptomedb2/
To cite StreptomeDB, please reference:StreptomeDB 3.0: an updated compendium of streptomycetes natural products.
Moumbock AFA, Gao M, Qaseem A, Li J, Kirchner PA, Ndingkokhar B, Bekono BD, Simoben CV, Babiaka SB, Malange YI, Sauter F, Zierep P, Ntie-Kang F, Günther S. Nucleic Acids Res., 2020. DOI: 10.1093/nar/gkaa868.

6. SuperNatural III
主要和次要代谢物以及天然大分子的化学结构
https://bioinf-applied.charite.de/supernatural_3/index.php
天然产物（NPs）是一种生物在自然界中产生的单一化合物、物质或混合物。从进化上讲，NPs自数千年以来一直被用作治疗剂，直到今天仍然是新的潜在治疗制剂的最重要来源。天然产品在传染病药物发现中发挥了关键作用。此外，随着消费者对天然食品成分的需求不断增加，近年来人们做出了许多努力来发现天然低热量甜味剂。SuperNatural 3.0是一个免费提供的天然产品和基于天然产品的衍生物数据库。更新版本包含790096种不同的结构，包括异构体和449058种独特的天然化合物及其结构和物理化学信息。此外，还为天然化合物提供了关于途径、作用机制、毒性、供应商信息（如果可用）、抗病毒、抗菌、抗疟、抗癌等几种疾病的类药物化学空间预测以及中枢神经系统（CNS）等靶向特异性细胞的信息。此外，还提供了一个有价值的天然化合物库，其中有望发现潜在的高价值化合物。使用其VirtualTaste模型可预测天然化合物的性质。

7. Encycle Pedia of RIKEN (NPEdia)

http://www.cbrg.riken.jp/npedia/?LANG=en
来自植物和微生物的天然产物，侧重于结构特征。

8.mzCloud

mzCloud包含在许多实验条件下获得的高分辨率和低分辨率光谱数据库，用于使用串联质谱法鉴定小分子，可自由搜索的光谱、光谱树、结构、碎片、母离子、色谱数据和化合物相关参考文献等内容。
https://www.mzcloud.org/

9. HmBd Human Metabolome Database

人类代谢组数据库 (HMDB) 是世界上最大、最全面的生物体特异性代谢组数据库。它包含关于所有当前已知的人类代谢物的丰富注释、仔细交叉检查、广泛引用的信息。
https://hmdb.ca/

10. ReSpect for Phytochemicals

植物化学物质光谱数据库 (ReSpect) 是用于植物代谢组学研究的光谱数据的集合，目前有9017个光谱记录可用，该网站于2013年停止更新，但是仍然可以使用。
Latest News 2013.11.11 5 spectra was added (data update)
http://spectra.psc.riken.jp/

11.PubChem
PubChem is the world's largest collection of freely accessible chemical information. Search chemicals by name, molecular formula, structure, and other identifiers. Find chemical and physical properties, biological activities, safety and toxicity information, patents, literature citations and more.
https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

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